吉林医药学院有1个校区，吉林医药学院本部。
吉林医药学院始建于1952年。学校坐落在吉林市，学校是国家绿化模范单位、吉林省园林式单位。校区位于吉林市吉林大街5号，校本部占地面积52.60万平方米，建筑面积27.42万平方米，固定资产8.60亿元，教学、科研仪器设备总值7315.51万元。馆藏纸质图书80万册，中外文数据库23个；文体活动中心建筑面积0.50万平方米；体育运动场占地面积5.16万平方米；校园主干网为千兆带宽。
吉林医药学院本部位于吉林市丰满区华山路81号
截至11月，学校占地面积52.73万平方米，建筑面积27.42万平方米。固定资产11.41亿元，教学、科研仪器设备总值1.66亿元。
院系设置
| 人文社会科学学院 | 基础医学院 | 临床医学院 |
| 药学院 | 护理学院 | 检验学院 |
| 公共卫生学院 | 口腔影像系 |
