京协和医学院有1个校区，校本部。
中国协和医科大学其前身是"北京协和医学院"。中国医学科学院成立于1956年，是我国唯一的国家级医学科学学术中心和综合性医学科学研究机构。现有中国科学院和中国工程院两院院士28人，“*”人选14人，教育部“*奖励计划”特聘教授15人，*讲座教授3人，杰出青年基金获得者35人，国务院学位委员会委员1人、学科评议组成员9人，在岗博士生导师654人，硕士生导师845人。
校本部：北京市东城区东单三条9号
为探求中国高等医学教育改革的创新模式，北京协和医学院与清华大学于2006年9月起开展合作办学，可同时使用“北京协和医学院??清华大学医学部”作为第二名称，并依托清华大学，部分进入“211”和“985”工程平台建设行列。
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