学校前身是安庆卫生学校，办学历史可以追溯到1943成立的“安徽省省立立煌高级助产护士职业学校”，是安徽省最早开办的公立医学教育学校。2007年3月，独立升格为安庆医药高等专科学校，填补了皖西南医药高等教育空白。
学校占地面积630亩，建筑面积14万平方米，教学仪器设备值4千余万元。现有教职医护员工633人。其中，教授3人（二级教授1人），主任（中）医师3人，副教授、副主任（中）医师等副高级职称77人，具有硕士及以上学位教师106人。省学科带头人1人、高职高专专业带头人5人、先进工作者1人、优秀教师4人、教学名师4人、教坛新秀8人，享受国务院政府特殊津贴1人、市政府特殊津贴2人。
现有临床医学系、药学系、护理系以及公共基础部以及直属附属医院1所，非直属附属医院3所，近200家校外实习实训基地。开设临床医学、康复治疗技术、医学影像技术、医学检验技术、公共卫生管理、药学、中药学、药品生产技术、药品质量与安全、药品经营与管理、保健品开发与管理、护理、助产等13个普通专科专业，在校生8千余人。
医药护主干专业已全部获批为省级特色专业或专业综合改革试点专业。现有央财支持的提升专业服务产业发展能力专业2个、实训基地2个，国家“十一五”重点专科1个，省级特色专业3个、综合改革试点专业2个、示范实训中心4个、教学团队1个、精品资源共享课程5门、校企合作实践教育基地1个、教学成果二等奖、三等奖各2项，省高等教育振兴计划项目5项，省中医药事业发展专项资金项目1个，市级科技成果奖1项。承担省自然科学、人文社科类研究重大项目等教科研课题达30余项。校级精品课程18门，省级精品资源共享课程4门。发表论文110余篇。实用新型专利4项。
学校是教育部对口支援西部教育成员单位、中国传统医学联合会副会长单位、全国卫生职业教育康复技术研究会副会长单位、全国卫生高等职业教育协会常务理事单位、全国医药职业教育联盟成员单位，省药学专业技术人员继续教育基地，市“红十字救护培训基地”。是连续3届的“全国文明单位”、中华全国总工会“模范职工之家”。
办学73年来，学校坚持“科学定位，错位发展，提升内涵，彰显特色”的办学理念，已累计培养了4万余名应用型人才。
